Uma equipe de exploradores composta de soldados e cientistas viajam através do Stargate, um portal que dá acesso a outros planetas. Eles usam a passagem para explorar novos mundos e proteger a Terra contra forças inimigas.
Um piloto da Força Aérea tenta remontar o SG-1 depois de terem seus caminhos separados. Um velho “amigo” chega à Terra pedindo a ajuda de Daniel para encontrar um tesouro antigo – e ela não vai aceitar um não como resposta.
Um dispositivo de comunicação antiga deixa Daniel e Vala inconsciente, enviando suas mentes para outra galáxia – onde habitam os corpos de duas pessoas perseguidas pelos seguidores de uma religião do mal.
Daniel fica cara a cara com o Ori, em uma corrida impetuosa dos seres que exigem a adoração dos mortais. Em outro lugar, o SGC encontra o primeiro missionário Ori em nossa galáxia.
Jackson e Mitchell devem se juntar a Vala em uma caçada interplanetária, quando descobrem que ainda estão unidos por um campo de energia alienígena.
O SG-1 visita um mundo cujo povo, que uma vez adorou Vala como uma deusa, e agora exigem que ela seja julgada quando confessa que os manipulava.
Samantha Carter retorna ao SGC quando os Ori tomam o controle de um planeta, usando um campo de força expansivo, para ganhar uma posição na nossa galáxia.
O SG-1 investiga evidências que sugerem que ainda há Goa’ulds escondidos na Terra, incluindo um ex-Senhor do Sistema. As tensões entre a Terra e os Jaffas livres, continuam a crescer.
O Coronel Mitchell é ferido em um confronto com um guerreiro de uma mitica tribo de rebeldes Jaffa, e acaba sendo treinado em suas técnicas de luta, apenas para que possa se envolver em uma batalha ritual até a morte.
O SG-1 encontra um híbrido Goa’uld humano geneticamente avançado criado por Anubis, eles o trazem à Terra para ser estudado. Mas mantê-lo vivo, pode não valer o risco.
A Terra está infectada com uma praga mortal Ori, o que leva um aliado do passado do SG-1, a vir aqui paras ajudar. Gerak propõe que o Jaffa livres, sigam a religião Ori.
Como a praga Ori se espalha rapidamente, o SG-1 espera que a priori, o que causou a doença, pode ser a chave para sua cura. Gerak tenta unir o Jaffa à causa do Ori, levando Teal’c e Bra’tac a iniciar uma resistência.
Quando o SG-1 viaja para um planeta Asgard protegido, o Coronel Mitchell é acusado de um crime que não cometeu.
Vários SG-1s aparecem no SGC, levando a equipe “real” a concluir, que cada um deles foram inadvertidamente deslocadas a partir de diferentes realidades paralelas.
Baal sequestra Teal’c, como parte de uma conspiração para lavagem cerebral daqueles Jaffas que defendem um movimento em direção à democracia. Cameron Mitchell descobre que um velho amigo está prestes a morrer.
Daniel está preso em um mundo sob a influência do Ori, e a Prometheus é pega em um tiroteio quando o SG-1 tenta resgatá-lo.
O SG-1 é capturado depois que um acordo com a Aliança Lucian vai mal, e o Stargate do planeta desaparece. Enquanto isso, um ex-Senhor do Sistema tenta reconstruir seu império.
Um passeio, em uma base de pesquisa fora da Terra para um grupo de diplomatas estrangeiros, se torna perigosa quando uma espécie de inseto fica solto.
Mitchell e Carter são deslocadas para uma outra dimensão, tornando-os invisíveis para todos no SGC. Enquanto isso, Teal’c e o SG-9 descobrem que o Sodan foi brutalmente atacado.
Vala Mal Doran faz contato com o SGC da galáxia dos Ori, e conta a história de sua vida secreta em uma vila de seguidores que constroem uma frota de invasão Ori.
O SG-1 descobre a vila de Camelot em um mundo alienígena, e deve enfrentar o sistema de segurança de Merlin quando vão em busca de uma arma antiga. Em outro lugar, a Terra e os seus aliados montam uma frota quando um Super Stargate é descoberto.
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